现行排污费由环保部门征收，改征环境保护税后，将由税务机关按照税收征管法的规定征收管理，增强了执法的规范性、刚性。同时，考虑到征收环境保护税对污染物排放监测的专业技术要求较高，离不开环保部门的配合，环境保护税法确定了企业申报、税务征收、环保协同、信息共享的征管模式。即纳税人应当依法如实办理纳税申报，对申报的真实性和完整性承担责任；税务机关依法征收管理，环保部门负责依法对污染物监测管理；环保部门与税务机关须建立涉税信息共享平台和工作配合机制，定期交换有关纳税信息资料。这一征管模式突出了纳税人自主如实申报纳税的义务，明确了税务机关征税的主体责任，并要求环保部门对排污征税提供信息核查，配合做好税务征管工作。
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